地理位置、范围
四川蜂桶寨国家级自然保护区位于雅安地区宝兴县境内，涉及硗碛、盐井、民治、中坝及穆坪共五个乡镇。地理位置：东经102゜48′—103゜00′，北纬30゜19′—30゜47′。范围包括：保护区东河以东部分，北面与卧龙国家级自然保护区相连，东与芦山县为邻，西北面至锅巴岩正沟与柳落沟的分水岭，南抵穆坪镇中坝至金台山山脊，西北以东河沿线国有林与集体林界线为界；东河以西部分，包括大水沟、桦溪林沟、快乐沟、得胜沟汇水面积中的国有林地部分（详见保护区总体规划图）。保护区总面积39039公顷，全为国有林地。
地形、地貌
保护区地处青藏高原向四川盆地过渡的邛崃山脉中段。区内地势东南低、西北高，山体剧烈抬升，河流强烈下切，形成山高、坡陡、谷狭的地形。海拔4200米以上山体，集中分布在保护区北段，最高点在北侧二十四凼，海拔4896米，南缘最低海拔1000米左右，区内相对高差3800米左右。地形起伏大，高差悬殊，山势陡峭，沟壑纵横，山峦叠翠，自然景观雄伟、壮丽。冲积堆、坡积丘主要堆积于主支流交汇处和山坡下部，零散破碎。冲积和洪积台地分布在河流两岸，为农作物地带。
地质、土壤
本区位于龙门山地槽区，出露地层有前震旦系、震旦系、奥陶系、志留系、泥盆系、三迭系、第四系和元古代的澄徵江—晋宁期的岩浆浸入岩。主要由玄武岩、火山角砾岩、花岗岩、片岩、千枚岩、大理岩、白云岩、白云质灰岩、细砂岩及砂砾等组成。
土壤类型多样，垂直带谱明显。由下而上主要有山地黄壤（海拔1000—1500米）、山地黄棕壤（海拔1500—2000米）、山地棕壤和暗棕壤（海拔2000—2900米）、山地灰化土（海拔2900—3500米）、高山灌丛草甸和高山荒漠土（海拔3500米以上）。
气候、水文
本区气候属四川盆地亚热带湿润气候区的西部边缘地区气候。年均温5.9—7.2°C，一月均温-4.0—2.7°C，七月均温15.1—16.3°C，极端最高温25.5—27.7°C；无霜期228—242天；年平降水量700—1300毫米；年平均相对湿度79—83%；全年平均日照数为967.1小时。
东河是保护区的干流，两岸支流极不对称，西岸有得胜沟、大水沟、桦溪林沟、快乐沟；东岸有锅巴岩沟、汪家沟、青山沟、邓池沟、龙石溪、甘木沟、冷木沟等。
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